La Fundación FISO se encuentra inscripta en Colciencias y la Red Latinoamericana de Investigación como ente investigador. Actualmente FISO se desempeña en las siguientes líneas de investigación:   1. Salud Ocupacional: Línea dedicada al desarrollo de instrumentos, herramientas, manuales e insumos que de manera general le facilitan a las empresas mejorar sus condiciones de trabajo. 2. Salud Ambiental: Línea dedicada al desarrollo de modelos para buscar soluciones integrales a los problemas que afectan la salud de los trabajadores y de la población en general, hacia el camino del desarrollo sostenible (producción limpia, uso y control alternativo natural, sellos verdes, etc.). 3. Promoción de la Salud de los Trabajadores: Línea dedicada a fomentar y promover las mejores condiciones para el trabajador, de manera que se mantenga en actitud productiva. (Trabajo saludable, motivación, etc.). 4. Políticas y Legislación comparada a nivel Regional: Línea dedicada a la asesoría para formular políticas públicas, planes y desarrollo de proyectos en beneficio de los países de América Latina, a través del intercambio de experiencias de otros países con características similares. 5. Financiera y Actuarial: Línea dedicada a la economía de la salud ocupacional y a los estudios financieros de la administración de riesgos de trabajo, por medio del desarrollo técnico compatibilizado con la teoría financiera y actuarial. 6. Violencia y Trabajo: Línea dedicada al análisis del impacto de la violencia dentro del mundo del trabajo, buscando soluciones por medio de instrumentos, métodos y estrategias. 7. Medicina Laboral: Línea dedicada al desarrollo de instrumentos, procedimientos y proyectos que permitan conducir al trabajador al retorno a la vida laboral. (Reincorporación, reubicación, reconversión, y readaptación del trabajador a su vida normal de trabajo).